UvaasaExEdin tarjoamien eMBA-ohjelmien laadusta ja tieteellisestä sisällöstä vastaa Vaasan yliopiston akateemisten yksiköiden professoreista koottu akateeminen neuvosto (eMBA Academic Council). Ryhmän puheenjohtajana toimii ExEdin toimitusjohtaja. Jäsenet, jotka ovat yliopiston sisäisiä asiantuntijoita kaikista eMBA-ohjelmista toimivat sekä eMBA-ohjelmien tieteellisinä asiantuntijoina että moduuleista vastaavina professoreina.
Neuvoston tärkeimpänä tavoitteena on varmistaa tarvittava akateeminen laatu ja toimintatavat. Se vastaa eMBA-ohjelmien opintosuunnitelmien hyväksynnästä ja kehittämisestä asiakas- ja opiskelijapalautteen perusteella. Lisäksi neuvosto toimii pääkontaktipintana osakeyhtiön ja akateemisten yksiköiden välillä. Akateeminen neuvosto kokoontuu kaksi kertaa vuodessa, jolloin se päivittää opintosuunnitelmat ja tekee parannusehdotuksia saatujen palautteiden perusteella.
